新型コロナウイルスの影響で，郵船クルーズは2月24日，飛鳥Ⅱの３月，４月出発のクルーズ中止を発表した。３月11日発からの７本とすべてのチャータークルーズ，４月２日発の「2020年世界一周」を中止する。商船三井客船は２月25日，“にっぽん丸”の４月12日発「飛んでクルーズ沖縄Aコース～宮古島・台湾」の中止を発表した。台湾当局の入港拒否に基づく措置で，14日に基隆に寄港予定だった。なお同船は現在改装工事中で３月から４月初旬の稼働はない。日本クルーズ客船は２月25日，“ぱしふぃっく びいなす”の２月27日発から４月27日発までの13本の中止を発表した。５月以降は運航予定という。また，せとうちクルーズはガンツウの３月１日から４月29日までの運休を決めたほか，ピースボートはオーシャンドリームOcean DreamとゼニスZenithの４月出港の世界一周を中止した。