日本外航客船協会（JOPA）は新型コロナウイルス感染予防対策ガイドラインを作成し，５月14日付けで発表した。外航旅客船事業者が事業実施のために必要な感染拡大予防策として，流行が終息するまでの当分の間，推奨される実施事項を整理したもので，国交省の要請に基づいてまとめられた。乗客や乗組員への感染予防策，有症者が発生した場合や有症者の感染が確定した場合についてなど，項目ごとに乗船拒否の判断や乗組員の上陸について記載されている。５月時点での政府や専門家の対処方針を踏まえて作成されており，内容は適宜更新される。日本旅客船協会，日本内航海運組合総連合会，日本旅行業協会，日本ホテル協会などの各団体も同様のガイドラインを発表している。